科學哲學是以科學作為研究的主題，去探討其中的哲學問題。從哲學的角度來探討科學，有別於從歷史的角度、心理學的角度、或是社會學的角度來進行的理解：我們發問的問題並不是像「Einstein的狹義相對論是否受到了他第一任妻子的啟發？」也不是像「為何Newton不親自與Leibniz論戰，而要透過Clarke的代筆？」或是諸如「為何史達林統治下的蘇聯生物學家拒絕接受Mendel的遺傳學？」等等的問題。從哲學的角度來探討科學為何，所提出的重要議題如下：
（1） 在人類的知識領域當中，科學的獨特性何在？科學與偽科學之間是否有明確的劃界？若有，其判準為何？這樣的判準是否真的成立？
（2） 科學的推論如何進行？科學的推論方式能否證成？
（3） 科學理論如何予以經驗測試？理論如何被經驗證據給支持？面對互相競爭的科學理論，如何評判其優劣？
（4） 科學理論在歷史中的演變方式為何？這樣的演變是否合乎理性？
（5） 科學理論的作用之一乃是說明所觀察到的經驗現象，但這樣的說明如何進行？
（6） 科學理論中有許許多多的定律，這些定律一向被視為普遍、必然地為真。但何謂「定律」？科學定律是否普遍必然地為真？
（7） 科學理論旨在揭露隱於經驗現象背後的實在嗎？或者科學理論只是便於計算、預測以及建立可觀察現象彼此之間之關聯的工具而已呢？
（8） 科學知識和科學事實是否來自社會的建構？是否都受到利益、權力、意識型態等社會因素的影響？
在討論這些議題之前，我會先交代它們出現的脈絡，以作為同學們的背景知識。本課程並不預設同學們修過其他的哲學相關課程，也不預設同學們具備科學訓練的知識背景。甚至，本課程十分期待同學們在吸收授課內容之後，能夠對照一般人文學科與自然學科的不同，進一步理解各自的特色。